Het bestuur van Leiden-Delft-Erasmus Universities wordt gevormd door de leden van de Colleges van Bestuur van de Universiteit Leiden, TU Delft en Erasmus Universiteit Rotterdam.
Het voorzitterschap rouleert onder de voorzitters van de drie Colleges. Sinds 1 januari 2025 is prof. dr. Annelien Bredenoord, voorzitter van het CvB van de Erasmus Universiteit Rotterdam, voorzitter van het LDE-bestuur.
De decanen van de faculteiten van de drie universiteiten zijn nauw betrokken bij de samenwerking op het gebied van onderwijs, onderzoek en valorisatie, onder meer als leden van de stuurgroepen van de Leiden-Delft-Erasmus centres.
Stuurgroepen
Centre for Sustainability
Prof.dr. Jasper Knoester
Dr. Mirko Benischke
Prof.dr. Cocky Hilhorst
Centre for Governance of Migration and Diversity
Prof.dr. Marjolijn Antheunis
Prof. dr. Maarten van Ham
Prof.dr. Suzan Stoter
International Centre for Frugal Innovation
Prof.dr. Ruard Ganzevoort
Prof.dr.ir. Machiel van Dorst
Prof.dr. Bart Barendregt
Centre for Bold Cities
Prof.dr. Koen Caminada
Prof.dr.ir. Caspar Chorus
Prof.dr. Marjolijn Antheunis
Centre for PortCityFutures
Prof.dr.ir. Machiel van Dorst
Prof.dr. Bart Barendregt
Prof.dr. Martine van Selm
Programme for Heritage and Development
Prof.dr. Alex Geurds
Prof.dr.ir. Machiel van Dorst
prof.dr. Stijn Reijnders
Programme for Healthy Society
Prof.dr. Bart Barendregt
Prof.dr.ir. Caspar Chorus
Prof.dr. Maarten IJzerman
Programme for Climate and Biodiversity
Prof.dr. Jasper Knoester
Dr. Mirko Benischke
Prof.dr. Cocky Hilhorst
LDE Global
Prof.dr. Ruard Ganzevoort
Prof.dr.ir. Machiel van Dorst
Prof.dr. Bart Barendregt